Переплата по транспортному налогу.

Здрвствуйте! У меня вопрос в следующем. Что-б было понятно-немного истории. В 1999 г.я купил мотолодку"Крым" и 2 лодочных мотора. Т.к. лодка одномоторная-один двигатель был зарегистрирован как основной. В 2003 году лодка была продана и снята с учёта в ГИМС. Следом в 2003-м была приобретена мотолодка "Обь-3",так-же одномоторная и оба двигателя оставшиеся от прежней лодки были вписаны в судовой билет как один основной и один запасной. Все годы в квитанциях о налогах были указаны именно двигатели, и платил за оба, хотя в инспекции мне указали что оплата должна быть только за основной мотор. В 2014 году лодка "Обь-3"была снята с учёта с целью продажи и в этом году выясняется что за мной числится предыдущая мотолодка "Крым",в квитанциях налоговой стали указываться не двигатели как ранее, а бортовой номер мотолодки "Крым"-Р 48-58 ИД. Сейчас письмо с судебным решением пришло в бухгалтерию удержать с меня налог за лодку за 2015 и 2016 годы. При обращении в налоговую мне было сказано что с 2014 года лодка "Крым" за мной не числится. В документе от ГИМС указано что она снята мною с учёта в 2003 году. Получается что я платил с 2003 года за несуществующую лодку и плюс к тому по решению суда бухгалтерия должна вычесть из моей зарплаты долг за эту лодку за 2015 и 2016 годы включая пени. В налоговой был сделан перерасчёт,ответили что переплату не вернут, а бухгалтер должен руководствоваться письма. Как быть? Что платить? Кому платить?