Как преодолеть сложности в работе в отделе кадров - кто ответственен за кадровые документы и какие порядки должны быть в соответствии с общепринятыми нормами?

Год назад директор нашего предприятия попросил меня помочь начальнику отдела кадров составить и отправить в министерство отчет по персональному учету, который составляется с помощью специальной компьютерной программы. Как системный администратор я эту программу настраивала и обновляла, т.е. хорошо знала, как она работает. Специалист по кадрам, девушка, которая работала в этой программе, а также отвечала за кадровое делопроизводство, уволилась и на это место пробовалось несколько наших сотрудников. Поскольку я успешно справилась с отчетом, место было предложено мне. Я согласилась, меня перевели в отдел кадров, дирекция оплатила курсы по кадровой работе. Проблема состоит в том, что моя начальница не хочет передавать мне кадровые документы по акту приема-передачи - это личные дела, трудовые книжки, военно-учетный стол. Сотрудница, которая уволилась, никак не отчиталась и вообще оказалось, что кадровая работа велась у нас по каким-то своим законам. Например, все приказы по личному состатву хранились в одной папке, независимо от того, какой у них срок хранения. Архива у нас пока нет, но будет, все документы нуждаются в приведении в соответствующий порядок. Короче, чем больше я вникаю в эти дебри, тем больше у меня вопросов. Начальница сама занимается договорами и я в эту часть не допускаюсь, иногда только форматирую тексты. На все мои вопросы ответ один - мы тут десять лет работали ТАК и дальше будем, и нечего тут свои порядки устанавливать. Но порядки не мои, а общепринятые. Я прекрасно понимаю, что нужно писать служебную записку директору или уходить из отдела, хотя мне моя работа нравится. Начальница моя на пенсии, с компьютером у нее сложные отношения и т.д. А мне-то что делать? Ведь даже приказ, по которому меня перевели из одного отдела в другой, как я теперь понимаю, написан неправильно. У нас недавно стал работать приглашенный юрист, он говорит, что я и сама могу составить все акты, их ведь несколько человек должны подписать. Но я ведь не могу игнорировать своего непосредственного начальника. Что мне делать?