Как неправомерное удаление маршрутов убило бизнес пассажирских перевозок и как вернуться в игру

Порядок установления, изменения, отмены маршрутов регулярных перевозок устанавливается:

1) в отношении муниципальных маршрутов - законами или иными нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации - городов федерального значения Москвы, Санкт-Петербурга и Севастополя либо муниципальными нормативными правовыми актами;

2) в отношении межмуниципальных маршрутов регулярных перевозок - законами или иными нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации;

3) Отмена межрегионального маршрута осуществляется по согласованию между уполномоченными органами исполнительной власти субъектов Российской Федерации, в границах которых проходит данный маршрут.

Т.е. в отношении разных маршрутов порядок их отмены (исключения из реестра) устанавливают разные органы.

В вашем случае необходимо найти порядок установления, изменения, отмены маршрута и уже в нем читать законно или нет его отменили. Порядок, скорее всего, установлен вашим департаментом или вышестоящим для него органом.

Например, в моём городе, органом ответственным за перевозки является комитет, а порядок установления, изменения, отмены маршрутов установлен администрацией города. По межгороду порядок устанавливает уже иной орган - краевое правительство.

В вашем регионе действует Порядок организации маршрутов для выполнения регулярных перевозок пассажиров и багажа автомобильным транспортом общего пользования в межмуниципальном сообщении на территории Приморского края, Утвержден постановлением Администрации Приморского края от 11.10.2018 N 484-па (в ред. Постановлений Администрации Приморского края от 05.02.2019 N 56-па, от 11.04.2019 N 224-па). В нем надо искать ответ на ваш вопрос, т.к. информации вы выдали мало.