На что ссылаются что следователь может вынести процессуальное решение самостоятельно.

Следователь принимает решение самостоятельно. В соответствии со ст. 213 УПК РФ, уголовное дело прекращается по постановлению следователя, копия которого направляется прокурору. Т.е. это не означает, что постановление утверждается прокурором. Прокурор, признав постановление руководителя следственного органа или следователя о прекращении уголовного дела или уголовного преследования (за исключением дел частного обвинения) незаконным или необоснованным, отменяет его (ст. 214 УПК РФ).

Для этого вы должны направить ходатайство прокурору согласно ст.124 УПК РФ в котором разъяснить обстоятельства незаконного прекращения уголовного дела и просить отменить прекращение уголовного дела.

Напишите ходатайство следователю в 2 экземплярах (1-себе, 2-следователю), отдайте следователю под подпись ходатайство, на Вашем экземпляре он напишет дату и поставит свою подпись, должность и дату, с этого момента отсчитывайте срок 3 дня. В ходатайстве укажите все мероприятия, которые по Вашему мнению влияют на исход дела и Вы считаете нужным провести. Следователь рассмотрит ходатайство в указанный срок и вынесет решение об удовлетворении ходатайства, частичном удовлетворении, либо отказе в удовлетворении (ст. 122 УПК РФ)

Направьте жалобу на действия следователя прокурору в порядке ст. 125 УПК РФ, одновременно подайте жалобу в суд по этому же основанию. В жалобе приложите свое заявление и обоснование, почему Вы считаете, что решение вынесено необоснованно.