Можно ли переписать свою долю в квартире на сестру при наличии долга за нее?

МОжете заключить с сестрой договор дарения своей доли ст.572 ГК РФ договор надо будет удостоверить у нотариуса, поскольку это сделка с долями и зарегистрировать переход права собственности в Росреестре, долг по квартплате никак не влияет на Ваше право распоряжаться своим имуществом, так что препятствием это не будет.