Объясните, пожайлуста, чья это вина и какие шаги мне нужно теперь предпринять?

Уважаемая Юлия Михайловна! Ваш случай далеко не единичен. Вопрос может быть решен в судебном порядке. То, что Вы не числитесь в базе данных, не означает, что Вы не имеете гражданства РФ. Паспорт гражданина РФ является документом, свидетельствующим о наличии гражданства РФ. Если этот паспорт был выдан Вам на законном основании, то отменить решение о приеме Вас в гражданство РФ может только Президент РФ.

Статья 22. Основания отмены решений по вопросам гражданства Российской Федерации

Решение о приобретении или прекращении гражданства Российской Федерации подлежит отмене, если будет установлено, что данное решение принималось на основании представленных заявителем подложных документов или заведомо ложных сведений. Факт использования подложных документов или сообщения заведомо ложных сведений устанавливается в судебном порядке. В соответствии с ФЗ "О гражданстве РФ":

Статья 23. Порядок отмены решений по вопросам гражданства Российской Федерации и последствия такой отмены

1. Отмена решения по вопросам гражданства Российской Федерации осуществляется Президентом Российской Федерации или иным полномочным органом, ведающими делами о гражданстве Российской Федерации и принявшими такое решение.

2. Решение по вопросам гражданства Российской Федерации в случае отмены в соответствии со статьей 22 настоящего Федерального закона считается недействительным со дня принятия такого решения.

Так как прием в гражданство возложен этим же законом на ОВД, то даже если Вы были приняты в гражданство ошибочно, отменить это решение невозможно, если Вами не предоставлялось подложных документов или заведомо ложных сведений. Обращайтесь, готов оказать Вам помощь. Мои реквизиты - в каталоге юристов на данном сайте. С уважением, Дмитрий Константинович.