Как оформить квартиру после смерти матери и отчима, если у отчима есть сын от первого брака?

Если квартира приобреталась матерью до брака с отчимом, то после смерти матери вы с отчимом являлись наследниками первой очереди в равных долях - по 1/2.

после смерти отчима его сын является наследником его доли.

Если вы жили в квартире на день смерти матери то вы приняли наследство - обращайтесь к нотариусу и вступайте в наследство.

Если собственник Ваша мама, то причём тут вообще отчим и его сын?

Подавайте заявление нотариуса о принятии наследства.

Но Вы хотя бы указали был ли зарегистрирован брак между мамой и отчимом

Мать умерла: наследники - отчим и вы. Отчим считается фактически принявшим наследство, но не оформившим своих прав. Вы пропустили срок. Нужно обращаться в суд с заявлением о восстановлении срока и признании права собственности в порядке наследования.

Отчим умер: наследник сын. 1/2 доля квартиры, которую бы наследовал отчим, по наследству перейдет его сыну.

Вы свою 1/2 долю получите в судебном порядке (надо будет доказать уважительность пропуска срока, если таковой имел место быть). В случае удовлетворения Вашего заявления к нотариусу идти не нужно - с судебным решением в МФЦ, регистрировать право собственности.

Мать и отчим были в браке? Квартира была приобретена в браке или нет?

Если не состояли с браке, то все Вам достанется. Обращайтесь к нотариусу с заявлением о принятии наследства