Недостаток информации в законе об остатке прожиточного минимума приводит к непониманию работодателем о выплате зарплаты

Ваш бухгалтер, очевидно путает прожиточный минимум в рамках исполнительного производства, с минимальной зарплатой (МРОТ), которая действительно пропорционально отработанному времени начисляется и выплачивается. Здесь конкретно Вам должны оставлять прожиточный минмум. Если ваш доход получился меньше, то значит всё должны вам оставлять.. Ссылайтесь на ФЗ-229 ст. 99..

1.1. В случае, если в постановлении судебного пристава-исполнителя об обращении взыскания на денежные средства, находящиеся на счетах должника, заявлении должника, предусмотренном частью 6 статьи 8 настоящего Федерального закона, содержится требование о сохранении заработной платы и иных доходов должника ежемесячно в размере прожиточного минимума трудоспособного населения в целом по Российской Федерации (прожиточного минимума, установленного в субъекте Российской Федерации по месту жительства должника-гражданина для соответствующей социально-демографической группы населения, если величина указанного прожиточного минимума превышает величину прожиточного минимума трудоспособного населения в целом по Российской Федерации), удержание денежных средств осуществляется с соблюдением требования о сохранении заработной платы и иных доходов должника-гражданина ежемесячно в размере указанного прожиточного минимума.

Ну что здесь можно не понять? Все предельно ясно написано...