Могу ли я самостоятельно выбрать клинику для операции по квоте?

Да

Кулешов Андрей Валерьевич, не можете, т.к. только в той клинике в которую Вам выдали направление. Приказ Минздравсоцразвития РФ от 28.12.2011 N 1689 н "Об утверждении порядка направления граждан Российской Федерации для оказания высокотехнологичной медицинской помощи за счет бюджетных ассигнований, предусмотренных в федеральном бюджете Министерству здравоохранения и социального развития Российской Федерации, с применением специализированной информационной системы"

Нет не можете, так как направление выдается в конкретную клинику, а в другой Вас конечно примут, но только за деньги