Подскажите пожалуйста, что мне делать в данной ситуации и руководствоваться чьим приказом в данной ситуации?

Запросите официальные документы

В военкомате:

Получите письменные повестки с датами и временем обследований.

Попросите справку о явке после каждого посещения.

В МВД:

Запросите копию приказа о прохождении практики, где указаны ваши обязанности и график.

Уведомите руководство практики:

Напишите заявление на имя куратора практики:

«В связи с необходимостью прохождения медицинского обследования по направлению военного комиссариата [название] прошу предоставить мне возможность отсутствовать на практике в период с [дата] по [дата]. К заявлению прилагаю копии повесток и справок из военкомата».

Согласуйте график:

Предложите отработать пропущенные часы в другое время (например, вечером или в выходные).

Если МВД отказывает, обратитесь в чебный отдел вашего вуза/колледжа — они могут повлиять на организацию практики.

Если МВД настаивает на нарушениях:

Подайте письменное обращение в отдел кадров МВД с просьбой разъяснить, какой именно пункт приказа вы нарушаете.

Ссылайтесь на ст. 219 ТК РФ

Если военкомат выражает несогласие:

Сообщите военкомату, что МВД препятствует явке, и запросите перенос сроков обследования.

Предоставьте в военкомат письменный отказ МВД (если есть) — это будет уважительной причиной для переноса.

МВД должны пойти на встречу т.к. требования военкомата в приоритете.