Как влияет на льготную пенсию, если СОУТ 3.1, но отчет СФР менее 80%?

Да, это лишает вас права на досрочную льготную пенсию. Главное условие для включения периодов работы во вредных условиях в специальный стаж — это полная занятость, то есть выполнение обязанностей в режиме вредного производства не менее 80% рабочего времени . Поскольку работодатель официально указывает в отчетности, что вы не вырабатываете эту норму, Социальный фонд России (СФР) исключит эти периоды из льготного стажа, даже несмотря на наличие класса вредности 3.1 по результатам СОУТ .

Да, лишает.

Вам же описали алгоритм действий в вашей ситуации

влияет на льготную пенсию, если СОУТ 3.1, но отчет СФР менее 80% - нет

Вас это может лишить досрочной пенсии.

Право на досрочное назначение страховой пенсии по старости за работу в особых условиях труда определяется фактической занятостью на работах, предусмотренных Списками № 1 и № 2, постоянно в течение полного рабочего дня (не менее 80 процентов рабочего времени). При этом с 1 января 2013 года соответствующие периоды такой занятости засчитываются в стаж работы, дающей право на досрочное пенсионное обеспечение, при условии начисления и уплаты работодателем страховых взносов по дополнительным тарифам, предусмотренным статьей 428 Налогового кодекса Российской Федерации, а после проведения специальной оценки условий труда – при соответствии класса условий труда вредному или опасному классу условий труда.