Можно ли иметь несколько постоянных пропискок в одном городе?

иметь две постоянные «прописки» (регистрации по месту жительства) одновременно нельзя, ни в одном городе, ни в разных. Одновременно допускается только одна постоянная регистрация и одна временная.

Как это устроено по закону

В действующем праве нет понятия «прописка», есть регистрация по месту жительства (постоянная) и регистрация по месту пребывания (временная).

Согласно Правилам регистрации (Постановление Правительства РФ № 713):

Гражданин может иметь только один адрес постоянной регистрации по месту жительства.

Можно одновременно иметь одну постоянную и одну временную регистрацию по месту пребывания (например, живёте временно в другом жилье).

Две постоянные регистрации по разным адресам (в том числе в одном городе) законом не допускаются.

На практике при оформлении новой постоянной регистрации по одному адресу человека автоматически снимают с учёта по прежнему адресу. Отдельно ходить и «выписываться» не обязательно: это делает орган регистрации по форме заявления.

Если ваши родственники формально числятся сразу в двух местах (и в муниципальной квартире, и в другой, где реально живут), значит:

либо по факту где-то допущена ошибка, либо

по старому адресу у них не постоянная, а временная регистрация, либо данные просто не были доведены до актуального состояния.

Для проверки статуса регистрации по каждому адресу можно запросить выписку о зарегистрированных лицах (домовую книгу, справку из МФЦ/управляющей компании), а при необходимости — обратиться в подразделение по вопросам миграции МВД для приведения учёта в соответствие закону.