Т.е.квартира стала собственностью Покупателя, а Продавец оплату получит только после проверки Банком предоставленных документов?

Да, вы всё поняли верно: право собственности переходит к Покупателю на этапе регистрации в Росреестре/МФЦ, а деньги по сертификату переселенца Продавец получает позже — после того как банк проверит документы и одобрит перечисление. Это создаёт для Продавца риск временного разрыва между потерей права на квартиру и получением денег.

Как продавцу подстраховаться:

1. Аккредитив или счёт эскроу. По возможности настоять на расчётах через банковский аккредитив (безотзывный, покрытый) — деньги резервируются банком заранее и раскрываются по факту регистрации перехода права. Это надёжнее, чем просто "ждать перечисления после проверки".

2. Пункт ДКП об ипотеке/залоге в силу закона. Если расчёт идёт после регистрации, включите в договор условие о залоге квартиры в пользу Продавца до полной оплаты (ст. 488 ГК РФ) — это регистрируется одновременно с переходом права и даёт Продавцу залоговое обеспечение, а не голое обещание.

3. Чёткие сроки и порядок оплаты в ДКП. Пропишите точный срок, в течение которого банк обязан перечислить средства после подачи документов, а также порядок действий, если банк откажет (кто и как donesёт недостающие документы, право продавца на отказ от сделки/расторжение).

4. Проверка сертификата заранее. До подписания ДКП попросите Покупателя предоставить сам сертификат и уточнить в банке (сертификатодержателе) остаток суммы, срок действия сертификата, полный перечень требуемых документов — чтобы на этапе подачи в банк не всплыли сюрпризы.

5. Условие о расторжении и возврате права. Пропишите в ДКП, что если оплата не поступит в оговорённый срок (в том числе из-за отказа банка), Продавец вправе расторгнуть договор в судебном или досудебном порядке, а Покупатель обязан содействовать снятию записи о переходе права/возврату квартиры.

6. Титульное страхование или юридическое сопровождение сделки. Привлеките риелтора/юриста, который специализируется именно на сертификатах переселенцев (жилищных сертификатах) — там есть нюансы по конкретному банку-агенту и срокам проверки.

Отвечая прямо на ваш вопрос: да, при формальном подходе (переход права + пункт о залоге отсутствует) Продавец действительно рискует остаться и без денег, и без квартиры, если банк в проверке откажет и договор не предусматривает механизма защиты. Именно поэтому залог в силу закона (п.3) и чёткие условия о расторжении (п.5) — самые практичные инструменты защиты именно для этой схемы расчётов.