МРЭО отказало ставить машину на учет из-за отсутствия ВИН номера в регламенте - как действовать и возможно ли компенсация затрат?

В данном случае обжалуйте отказ в суд согласно ГПК РФ. Возьмите письменный отказ.Прилагайте письменный отказ.

Главное чтобы номер кузова и номер двигателя был в порядке. А вообще советую почитать Приказ МВД РФ от 24 ноября 2008 г. N 1001 "О порядке регистрации транспортных средств"

Как поставить машину на учет? И если нет, то компенсировать все затраты

Порядок действий с идентификационным номером кузова или рамы автомобиля, или VIN. Состоящий из букв и цифр, он, согласно правилам, должен быть читаем, доступен и не изменён, а также соответствовать требованиям ГОСТа и техрегламента. Если VIN пострадал в результате аварии или коррозии, то, если машина имеет вклейку об этом в документы (то есть, ранее зарегистрирована), она не ограничивается в эксплуатации. Вклейка – фотография VIN, сделанная сотрудниками ГИБДД и прикреплённая в техпаспорт транспортного средства, заменяющая собой повреждённый VIN кузова, считается законной.

Обратитесь с жалобой на имя начальника ГИБДД

Видимо Вам придется обращаться в суд о признании права собственности на автомобиль и обязании постановки автомашины на учет.Либо в судебном порядке расторгать договор и требовать возврата денег,так как Вам фактически продали негодный товар,введя Вас в заблуждение.

Обжалуйте отказ ГИБДД в регистрации ТС в суд!