Или лучше сделать это когда уже будет известен окончательный диагноз?

Согласно ст. 29 ЗАКОН РФ от 07.02.1992 N 2300-1 "ЗАКОНА О ЗАЩИТЕ ПРАВ ПОТРЕБИТЕЛЕЙ" ("Права потребителя при обнаружении недостатков выполненной работы (оказанной услуги)"):

п. 3. Требования, связанные с недостатками выполненной работы (оказанной услуги), могут быть предъявлены при принятии выполненной работы (оказанной услуги) или в ходе выполнения работы (оказания услуги) либо, если невозможно обнаружить недостатки при принятии выполненной работы (оказанной услуги), в течение сроков, установленных настоящим пунктом.

Потребитель вправе предъявлять требования, связанные с недостатками выполненной работы (оказанной услуги), если они обнаружены в течение гарантийного срока, а при его отсутствии в разумный срок, в пределах двух лет со дня принятия выполненной работы (оказанной услуги) или пяти лет в отношении недостатков в строении и ином недвижимом имуществе.

6. В случае выявления существенных недостатков работы (услуги) потребитель вправе предъявить исполнителю требование о безвозмездном устранении недостатков, если докажет, что недостатки возникли до принятия им результата работы (услуги) или по причинам, возникшим до этого момента. Это требование может быть предъявлено, если такие недостатки обнаружены по истечении двух лет (пяти лет в отношении недвижимого имущества) со дня принятия результата работы (услуги), но в пределах установленного на результат работы (услуги) срока службы или в течение десяти лет со дня принятия результата работы (услуги) потребителем, если срок службы не установлен.

Вообще желательно сразу подать претензию, в которой указать приблизительный расчет ваших убытков, и отметить, что точный расчет понесенных убытков вами убытков будет предъявлен вами по мере получения Вами соответствующих подтверждающих документов.

Желаю Вам успешного разрешения в создавшейся ситуации.

С уважением,

Елена Ханина.