Отказ от льготного проезда - правомерность действий отдела кадров при отпуске по уходу до 1,5 лет

Прав, у Вас нет отпуска. А оплата к месту отпуска.

Статья 325. Компенсация расходов на оплату стоимости проезда и провоза багажа к месту использования отпуска и обратно

[Трудовой кодекс РФ] [Глава 50] [Статья 325]

Лица, работающие в организациях, финансируемых из федерального бюджета, расположенных в районах Крайнего Севера и приравненных к ним местностях, имеют право на оплату один раз в два года за счет средств работодателя (организации, финансируемой из федерального бюджета) стоимости проезда в пределах территории Российской Федерации к месту использования отпуска и обратно любым видом транспорта (за исключением такси), в том числе личным, а также на оплату стоимости провоза багажа весом до 30 килограммов. Право на компенсацию указанных расходов возникает у работника одновременно с правом на получение ежегодного оплачиваемого отпуска за первый год работы в данной организации.

Пока вы в декрете вы не можете воспользоватся этим правом. Но если вы выйдите с декрета то право у вас это наступит

Можете попробовать немного "схимичить". Вы в любое время можете выйти из отпуска по уходу за ребенком (прервать отпуск) и сразу написать заявление на очередной отпуск. В этом случае действует статья 261 Трудового кодекса РФ, которая устанавливает, что:

"Перед отпуском по беременности и родам или непосредственно после него либо по окончании отпуска по уходу за ребенком женщине по ее желанию предоставляется ежегодный оплачиваемый отпуск независимо от стажа работы у данного работодателя."

Т.е. пишите заявление на очередной отпуск и убываете в него, получив то, что хотите - оплату проезда.

Выйдя на неполный рабочий день Вы не прервете отпуск по уходу за ребенком, а потому ежегодный оплачиваемый Вам в этом случае не дадут