Как быть, если совладельцы общедолевой собственности отказываются предоставить домовую книгу, и мы хотим оформить ее на половину, подаренную мне отцом, с супругом?

Можете. Действия вторых долевых собственников не законны. Может быть имеет смысл обратиться в суд с иском и требовать вдела Вашей доли в натуре. Это ведь не квартира и вполне очевидно, что можно оборудовать отдельный вход и т.д.