В настоящее время в квартире никто не прописан (отца я выписал, заплатил все его долги по квартплате и закрыл лицевой счёт).

Уважаемый Сергей! Всё, что Вы можете это отказаться от своей доли в наследстве в пользу сестры. Если брат убил своих родителей, то он может быть признан недостойным наследником. Воспрепятствовать его регистрации в квартире по месту жительства Вы не можете, т.к собственник после оформления своих прав (после обращения к нотариусу сроков для получения св-ва о праве на наследство и регистрации в Москомрегистрации права собственности нет) может регистрироваться в квартире без согласия другого сособственника. Ваша сестра также после оформления своего права сможет в квартире зарегистрироваться. Она сможет только определить порядок пользования квартирой, если возникнет спор(п.1 ст.247 ГК РФ). Раздел квартиры возможен только если в ней 2 кухни,2входа,2 санузла и есть изолированная комната,размер которой не более 1/3 доли жилой площади квартиры, получен и утверждён проект перепланировки одной квартиры на две, то есть возможен выдел в натуре(ст.252 ГК РФ). Сестра может продать свою долю с соблюдением права преимущественной покупки продаваемой доли за назначенную сестрой цену(ст.250 ГК РФ). При отказе от покупки доли или неполучении ответа от брата в месячный срок, можно продавать долю любому покупателю, но по цене не ниже объявленной, если такой покупатель найдётся. В противном случае придётся сосуществовать в квартире с братом. Не будет пускать, можно вселиться через суд, обратиться за содействием к участковому милиции.