АНО столкнулось с отказом в регистрации изменений должности директора - как поступить в данной ситуации?

Протоколом заседания попечительского совета Автономной некоммерческой организации от 04.08.2014 г. было принято решение уволить этим же числом директора и назначить с 05.08.2014 г. нового директора, употребив в названии должности исполняющий обязанности директора и подписать трудовой договор с ним, соответственно. Заверили заявление по форме Р 14001 у нотариуса и в 3-дневный срок с момента принятия решения сдали документы на регистрации изменений сведений в ЕГРЮЛ в Минюст. Сегодня позвонил специалист министерства и сообщил, что нашим уставом должность И.О. не предусмотрена (предусмотрена директор) и мы получаем отказ в регистрации. Не знаем как дальше правильно поступить, тк сотрудник уже трудится в новой должности с 05.08.2014 и не хотелось бы попадать под штрафные санкции. Правомерно ли будет составить новый протокол заседания АНО уже от 25.08.2014 с текстом.. На основании отказа, полученного от Министерства юстиции, решили внести изменения в протокол от 04.08.2014 г. и трудовой договор уже действующего ио директора с изменением наименования избранной должности на должность директор? А дальше уже 25.08.2014 заверить новое заявление у нотариуса и повторить процедуру подачи заявления. Будет ли такой порядок законным и не повлечет ли за собой штрафы за просрочку уведомления регистрирующих органов?