На что мне наш врач ответила, почему я не взял больничный вчера, когда вечером были у ЛОР-а?

Семья из 4 человек, (я)муж, жена и два сына (15 и 5 лет). Я работаю (инженер в ИТ отделе городской клинической больнице), супруга не работает уже 5 лет (с момента декретного) и в данный момент учится заочно на 3 курсе в медицинском. Старший сын ходит в школу, а младший (5 лет) ходит в садик уже 2 года. Младший, как пошёл в садик, так постоянно болеет, по этой причине супруга до сих пор и не работает. С ноября 2014 года и до сих пор мы не ходим в садик(то ОРВИ-ОРЗ, сейчас вот Отит). Сидеть с малышом наши родители не могут, по причине того что проживают в другом государстве и больше положится не на кого. Благо жена дома и ухаживает за ребёнком. Далее, недавно (летом 2014) у нас произошло радостное событие: мы купили квартиру на вторичном рынке. Но для покупки и ремонта, пришлось взять немалый кредит сроком на 5 лет в Банке Москвы, у которого я являюсь зарплатным клиентом. Это такое предисловие. Теперь по сути. У супруги с 12 января 2015 года началась заочная зимняя сессия, которая должна продлиться до 29 января. Занятия с 8 утра и до 16-18 по разному. С ребёнком, который до сих пор болеет, сидеть не кому. Естественно, мы это знали заранее. В начале 20х чисел декабря, я подошёл с этим вопросом к непосредственному начальнику отдела и объяснил ситуацию, что нельзя ли мне сделать плавающий график: скажем в некоторые дни я не выйду вообще(понимаю, что это не совсем правильно), а в некоторые буду приходить с 12 или 14 часов, по мере того, как моя супруга может уходить с сессии. И за то, что я не выходил - могу в дальнейшем отдежурить или отработать. Подходил неоднократно, раза 3 не меньше. Даже предоставил будущее расписание учёбы у супруги, что бы согласовать свой график. На что мне было сказано, что неплохо бы взять на это время больничный или уйти в отпуск. Я ответил, наверное можно и так, но в данный момент это не выгодно, потому как я теряю в ЗП, а с наличием кредита в банке, это просто расточительство. Руководитель и его зам, ответили,что в принципе можно решить эту проблему, прикрыв меня несколько дней.(Отдельно хочу сказать, что работник я добросовестный и всегда выполняю поставленные передо мной задачи в срок и порой делаю даже сверх своих обязательств, да-да именно так. Да и с непосредственным руководителем мы в дружеских отношениях (по крайней мере я так считал до сегодняшнего дня). ЗП у нас оклад+мотивация. Так вот как и всегда оклад маленький, а мотивация - бОльшая часть и в случае больничного мне оплатят ТОЛЬКО оклад. Прошли новогодние праздники, с руководителем после 31 декабря никак не общались, разве что поздравлениями на НГ. Да вот ещё забыл добавить, что ребёнок заболел 28 декабря, 29 вызвали участкового на дом, которая назначила лечение амбулаторно. Все праздники скакала температура 36.6- 38.4 , но ближе к 12 января, уже была только вечером. Но он всё ещё жаловался на левое ушко. Подходит 12 января и я со спокойной душой утром пишу СМС руководителю (почему СМС?, потому что по утрам совещания и не всегда можно дозвониться) Что так и так: У супруги два полных учебных дня, что я смогу приехать только в среду после обеда. Ответа не последовало. Я подумал, что всё нормально. И сижу с ребёнком 12 и 13 января. 13 января после приезда супруги с учёбы сходили в детскую поликлинику, потому как ушко надо было проверить. Сходили к ЛОРу, который поставил Отит. Об этом есть запись в больничной карте ребёнка. А сегодня утром, т.е. 14 января я узнаю, что на меня написали и составили акты о не явке на работу 12 и 13 января! Благо позвонили из канцелярии и спросили меня, что это за уведомление? Я тут же перезвонил руководителю, который сказал, что я якобы поставил его перед фактом своим СМС о не выходе на работу и что ему пришлось под давлением свыше актировать документы о неявки на работу. Стоят записи, что меня не было на месте 12 января в 9 и 12 часов и 13 января тоже в 9 и 12 часов. И что за отсутствие в течение 4 часов без уважительной причины, меня имеют право уволить по статье и тд. Я спросил, а почему нельзя меня было сразу предупредить о том, что ситуация выйдет из под контроля? На что было отвечено: не мог. И что я сам виноват, отпустив себя самого... и тд и тп... Спросил что мне сейчас делать в этой ситуации? Ответ Больничный. Прихожу с ребёнком в поликлинику и объясняю ситуацию, что нужен больничный и желательно с этого понедельника. На что мне наш врач ответила, почему я не взял больничный вчера, когда вечером были у ЛОР-а? И что может выписать только сегодня. Результат: больничный мне выписали сегодняшним числом 14 января и в зависимости от состояния ребёнка будут продлевать или не продлевать. Да, не приятно, что мотивацию я не получу, будет голый оклад, который не погасит и половины моего ежемесячного платежа по кредиту в банк. Теперь главный вопрос: что мне делать с прогулами 12 и 13 числа, которые за-активированы? Какие санкции против меня может выдвинуть руководство? И чем не это может грозить в трудовой книжке? Либо ещё где?Я конечно понимаю, что на этой работе свет клином не сошёлся, но у меня кредит и хочется стабильности. Сейчас просто тяжело менять работу. Какие мои дальнейшие шаги? Что мне делать в данной ситуации? (извините за столь подробное повествование)