Вопрос о ликвидации ООО с нулевыми отчетами при наличии трех участников и использовании доверенностей - допустимо ли указывать только директора и его доверенного лица в решении о ликвидации и назначении ликвидатор

Можно. Необходимо лишь чтобы в доверенностях были конкретно указаны полномочия на участие в собрании и принятия решения по вопросам ликвидации (так же указание как они доверяют проголосовать по этому вопросу ("за" или на усмотрение поверенного). Поскольку заявление в ФНС о начале ликвидации будет заверять нотариус - то он может потребовать предоставить ему доверенности отсутствовавших на собрании участников. Но на этом ликвидация не завершиться. Далее необходимо назначить ликвидационную комиссию (в состав которой обычно входят учредители, директор, главный бухгалтер, юрист, другие квалифицированные сотрудники) и выбрать её руководителя. Стоит заметить, что комиссия может состоять всего лишь из одного человека – ликвидатора. Паспортные данные каждого члена комиссии должны быть внесены в решение (протокол) о ликвидации. Комиссия или ликвидатор наделяются всеми полномочиями по управлению делами общества. Они представляют организацию в суде и несут ответственность за все действия совершенные на стадии ликвидации (статья 62 ГК РФ). Обратите внимание, начиная с 30 марта 2015 года, функции заявителя в процессе ликвидации должен выполнять руководитель комиссии или ликвидатор (ранее документы должен был подавать один из учредителей или участников ООО).