Вопросы связанные с увольнением беременной работницы за прогул и выплатой компенсации - какие права у меня есть?

Меня зовут Марина. Скажите мне пожалуйста руководитель может уволить меня по статье за прогул, так как я нахожусь в положении (беременна на 3-ем месяце). Руководитель издал Приказ и поставил статью за прогул по ТК РФ и уволил меня. Поставил задним числом то есть 13 июня, я расписалась 30 июня в Приказе. Перед этим я отпросилась у руководителя в отпуск за свой счет так как у нас, как он говорит нет отпусков и заявлении ему не интересны, на договорных условиях он меня отпустил с 29 мая по 12 июня 2017 на работу я вышла 13 июня работала все эти дни было все хорошо, но когда я сходила в женскую консультацию и сделали узи доктор сообщил, что вредный труд мне запрещен, а работа моя заключается с вредным производством (бензин и спирт). 20 июня я сообщила руководителю и взяла справку у доктора 26 июня. 30 июня он меня увольняет. Зарплату и по нарядные он мне ещё не выплатил и тем более пособие по увольнению тоже. Руководитель сказал думай до понедельника 03.07.17 мол можно исправить написать заявление по собственному и он сделает приказ другой и выплатит пособие по увольнению за 3 месяца по 5,5 тысяч рублей, хотя у меня в договоре прописано должностной оклад 11 тыс. рублей, ответ прозвучал что мол вы работаете на пол ставке и не весь день в договоре этого нет. Скажите, что мне делать идти в трудовую инспекцию и подавать жалобу об восстановлении, что меня незаконно уволили или соглашаться на их условии.