Как быть с днями оплаченного отпуска и, если делать перерасчет, ставить там прогулы?

В нашей фирме такая ситуация. Работнику предоставлялся отпуск частями (от 2 до 5 дней почти ежемесячно). Была такая устная договоренность. Расчетные листки с указанием начисленных сумм за отпуск работник получал ежемесячно. Причитающиеся ему выплаты получал полностью. В отпуск выходил за все время работы с 2006 года не каждый год. Приказов на отпуск было всегда много и не во всех он расписался. Теперь он требует снять эти дни (где нет его подписи в приказе) из начисления и вернуть как неотгуляные. Т.е., сейчас, когда он увольняется, по его словам, мы должны ему компенсацию за неиспользованные отпуска за прошлые годы. Какой срок исковой давности на возврат тех дней уже оплаченного отпуска? Как быть с днями оплаченного отпуска и, если делать перерасчет, ставить там прогулы? Он же не работал, а отпускные получил за эти дни! Если это нарушение у нас, то считается ли оно длящимся, это влияет на срок 3 месяца по ст 392 ТК РФ. Жалобу работник подал в прокуратуру. Какая предусмотрена ответственность нашей фирме. По КоАП, по ТК,или по УК?Какой из этих кодексов может коснуться нас. Хотя умысла с нашей стороны нет, просто у него такая специфика работы, что ежедневно выполнять трудовые функции ему не было необходимости. Спасибо за ответ.