Ведь документы на этих ресурсах нередко без подписи и печати органа издавшего этот документ?

Электронный документ это файл подписанный ЭЦП. Печатать указ президента не обязательно. Вы можете сослаться на него в своей жалобе. Все документы официально опубликованы, уполномоченное лицо может найти его при необходимости.

Вы можете просто на него сослаться (указав наименование, номер и дату, можно также указать необходимый фрагмент текста), все НПА можно найти в интернете, не обязательно их распечатывать, чтобы на него ссылаться

Необязательно скачивать НПАФ, достаточно на него сослаться.

Я просто делаю распечатку нормативно-правовых актов для пассажиров когда они просят показать нормативно-правовые акты на которые я смылаюсь на работе(например приказ Минтранса 43(о досмотре) 16 ФЗ "о транспортной безопасности). Но на распечатке нет подписи и печати органа издавшего нормативно-правовой акт и пассажиры говорят что это Филькина грамота а не нормативно-правовой акт в электронном виде. Как сделать так чтоб мои распечатки документов в электронном виде имели силу? Указать внизу(или вверху) распечатки электронной адрес сайта официальной правовой информации где по закону публикуются все нормативно-правовые акты?

Будет действующим документом. Не имеет значение, кто , где и когда его скачал.

Разумеется тот, кто будет применять этот документы проверит идентичность если нужно или просто будет руководствоваться своим текстом документа.