Можно ли подать отдельный иск, если не дали участвовать в деле?

Да, третье лицо вправе подать свой собственный иск. И это абсолютно нормальная, законная ситуация. То, что суд отказал в привлечении этого лица к текущему делу (потому что его вопрос, по мнению суда, не связан напрямую с предметом спора между истцом и ответчиком), не лишает его права защищать свои интересы отдельно.

Разберу логику, чтобы было понятнее.

Суть отказа. Когда суд говорит, что вопрос третьего лица не относится к сути дела, он оценивает связь этого вопроса с тем спором, который уже идёт. Например: в деле о взыскании долга по договору суд может решить, что отдельный спор третьего лица с одним из ответчиков о качестве сопутствующих услуг напрямую не влияет на исход основного дела. Но это не значит, что у третьего лица нет права судиться по этому сопутствующему вопросу в другом процессе. Свой путь. Если у лица есть самостоятельный материально-правовой интерес (то есть ответчик нарушил именно его права в какой-то отдельной сфере), оно подаёт отдельный иск. Здесь работает общее правило: каждый, чьи права нарушены, имеет право на судебную защиту (ст. 46 Конституции РФ, ст. 3 ГПК РФ / ст. 4 АПК РФ). А есть ли подводные камни?

Да, один важный момент стоит иметь в виду. Когда вы будете рассматривать дело отдельно, суд в новом процессе может учесть обстоятельства из первого дела (даже если вы в нём не участвовали). Но ключевое: для вас как для лица, не привлечённого к первому делу, установленные там факты не будут иметь преюдициального значения (то есть их не примут без доказывания). Суд просто примет их во внимание как одни из доказательств, но вправе дать им иную правовую оценку, если вы представите свои доводы. Поэтому в новом иске вам, скорее всего, придётся заново доказывать свои обстоятельства, а не ссылаться только на выводы из первого процесса.

Что в итоге?

Не пытайтесь «впихнуть» свой самостоятельный спор в текущее дело — суд снова откажет, и вы потеряете время. Лучше сразу готовить отдельный иск. Перед этим советую проконсультироваться с юристом: он поможет чётко отделить вопросы, связанные с основным спором, от ваших личных требований, и выстроить стратегию, чтобы в новом деле максимально эффективно отстоять свои интересы.