Вопросы взыскания переплаты и удержания из заработной платы при увольнении - правомочность действий организации

Произошла такая ситуация: В ноябре 2013 года по ошибке мне была дважды перечислена сумма командировочных в размере 16 500. В настоящее время мною было подписано расторжение трудового договора с работодателем по соглашению сторон, в связи с чем 5 апреля 2015 г. мне должны произвести окончательную выплату денежных средств со всеми задолженностями, которые мне должно предприятие (компенсация, 1 оклад, премия и неиспользуемый отпуск). В связи с чем, обнаружилось, что мне 1,5 года назад была повторно начислена упомянутая мной выше сумма командировочных. В настоящее время бухгалтерия требует, чтобы я оформила от руки заявление на удержание из заработной платы денежных средств. После игнорирования мной данного требования, бухгалтерия грозится оформить письмо о данной ситуации и отправить его руководству и юристам. Из всего вышесказанного, вопросы такие: имеет ли организация удержать данную сумму без моего согласия и моей подписи (учитывая, что прошло уже 1,5 года и за это время никто не обнаружил данную ошибку ни в квартальном, ни в годовом отчете)? Имеет ли право организация, в случае моего отказа вернуть упомянутую выше сумму через суд с процентами? На данный момент ситуация сложилась так, что я остаюсь без работы по вине организации, поскольку мною было подписано соглашение о расторжении трудового договора, речь о сокращении не шла, организация дала понять, что лучше уйти по хорошему, то есть по соглашению сторон. Либо причина для увольнения все равно будет найдена. Таким образом, сейчас для меня эти деньги очень важны. Имеет ли право организация взымать эти денежные средства единовременно, учитывая, что я остаюсь без работы и для меня будет очень сложно остаться без этих денег? А частично взымать каждый месяц какую-то часть суммы у компании не получится, поскольку, повторюсь, 5 апреля 2015 года - день моего увольнения и компания должна будет произвести со мной окончательный расчет.