Гражданин не является членом нашего трудового коллектива.

Принять на работу работника (заключить с ним трудовой договор) возможно только на вакантную должность, которая предусмотрена штатным расписанием.

Поэтому, если у Вас до настоящего времени нет в штатном расписании должности занимаемой данным работником, и нет необходимости ввводить данную должность, то Вам надо расторгнуть с ним трудовой договор.

Основанием расторжения трудового договора я вижу только пункт 2 части 1 статьи 81 ТК РФ - сокращение численности или штата, в приказе укажите что работник был ошибочно принят на должность, не предусмотренную штатным расписанием. Но его необходимо предупредить об увольнени за 2 месяца, т.е. сразу его уволить не получится, так как это не его вина, что его приняли на работу на несуществующую должность. Поэтому необходимо соблюсти все гарантии и компенсации, иначе суд станет на сторону работника, чьи права были нарушены.

А заработную плату, которую ВЫ вынуждены были заплатить этому работнику, можете в судебно порядке взыскать со своего зама, который исполнял обязанности руководителя и допустил эту ошибку. Основание причинения ущерба - работник, не указанный в штатном расписании не участвовал в создании результата работы компании, поскольу данная должность не была экономически обоснована (бизнес-план и.п.).

Помните еще о том, что суды почти всегда встают на сторону работников и поэтому в увольнении надо соблюсти все формальности.

И совет - примите на работу юрисконсульта, он свою должность оправдает.