Сотрудник компании требует выяснить неправомерное удержание суммы при расчете и угрожает обращением в прокуратуру - что грозит начальству?

В компании работал сотрудник, сейчас он уволен по собственному, был с ним расчёт на определённую сумму, но руководитель отдал сотруднику сумму меньшую чем в расчетном листе, разницу в сумме он оставил на то чтобы перекрыть расхождения по товару, которые возникли ещё при работе с тем сотрудником. Документально это никак не зафиксировано. Сотрудник потребует справку 2 ндфл, для прокуратуры. Сможет ли прокуратура этот факт выяснить! И что грозит начальству данного сотрудника?