Есть ли шанс добиться чего либо через суд. Всё что могу предоставить это сведетелей готовых подтвердить что я работал на обьекте.

Александр, представьте себе ситуацию, когда человек приходит на собеседование в компанию, его встречает менеждер по подбору персонала, они мило беседуют, менеждер говорит, что человек принят и может идти работать, и что договор ему скоро выдадут. Кто будет ответственным - компания, от лица которой действовал менеждер, или сам менеджер?

Поэтому у Вас два пути: пытаться взыскать с "шарашника" и пытаться взыскать с генподрядчика. Во-первых, нужно понимать, что у компании денег больше по определению, и что "шарашник" может скрыться от суда и приставов, а компания из-за такого небольшого долга скрываться не будет. Во-вторых, сам тот факт, что Вы работали на территории, где производил работы генподрядчик, пусть и по договорённости с сотрудником генподрядчика, говорит о том, что Вы фактически стали сотрудником генподрядчика (Вы были допущены к выполнению работ, которые доложен производить по договору генподрядчик). Если Вам удастся у генподрядчика получить договор подряда и договориться с некоторыми сотрудниками (возможно, с самим "шарашником", это будет положительно. Более того, Вы можете вести двойную игру - "шарашнику" говорить, что будете взыскивать с компании, компании - продолжать говорить, что взыскиваете с "шарашника", получая с них доказательства. В общем, вариантов множество. Чтобы было проще, поручите ведение дела в суде юристу.