Можно или нет проводить общее собрание в одной организации по подразделениям в течении полугода с одной и той же повесткой дня.

Нормами ТК РФ не регламентирован порядок проведения общего собрания, конференции трудового коллектива.

С точки зрения Федерального закона от 19.05.1995 N 82-ФЗ "Об общественных объединениях" трудовой коллектив - это орган общественной самодеятельности. Ст.12:

Органом общественной самодеятельности является не имеющее членства общественное объединение, целью которого является совместное решение различных социальных проблем, возникающих у граждан по месту жительства, работы или учебы, направленное на удовлетворение потребностей неограниченного круга лиц, чьи интересы связаны с достижением уставных целей и реализацией программ органа общественной самодеятельности по месту его создания.

Орган общественной самодеятельности формируется по инициативе граждан, заинтересованных в решении указанных проблем, и строит свою работу на основе самоуправления в соответствии с уставом, принятым на собрании учредителей. Орган общественной самодеятельности не имеет над собой вышестоящих органов или организаций.

Соответственно, если есть Устав, то в этом Уставе должно быть написано, с какой периодичностью можно собирать подобные собрания. Из практики - обычно оно созывается советом трудового коллектива по мере необходимости, но не реже двух раз в год.