Может ли быть такая фраза в договоре, если нет, то подскажите, как по другому выразить эту мысль.

Уважаемые коллеги, пожалуйста читайте внимательно вопрос и не морочьте вопрошающему голову! О каком "фактическом обременении в пользу банка" и тем паче "фактическом праве собственности банка" Вы говорите? Откуда Вы это взяли?

В пункте договора, в отношении которого высказано сомнение, речь идет о праве продавца квартиры (а не банка!) удерживать квартиру уже после государственной регистрации права собственности покупателя на нее, но до полной ее оплаты за счет кредита. Вероятно, этот пункт договора внесен по инициативе продавца.

Пункт сформулирован не слишком удачно. Более того, наличие данного пункта в тексте договора может стать причиной отказа в государственной регистрации сделки. Вопрошающий совершенно справедливо указывает на то, что право владения квартирой является составной частью права собственности на нее, поэтому сохранение за продавцом права владения (почему не пользования?) после государственной регистрации права собственности покупателя на квартиру - это нонсенс. Подобный пункт из договора должен быть исключен.

Закон (п.5 ст. 488 ГК РФ) предполагает иное средство защиты прав продавца в подобном случае - нахождение квартиры в силу закона в залоге у продавца до момента ее полной оплаты.