Проблемы с получением свидетельств о праве собственности на новостройку - Как действовать дальше?

Я собственник 1/2 части земельного участка и дома. Вторая 1/2 часть принадлежит соседу. Есть соглашение меду нами о порядке пользования земельным участком. С указанием границ земельного участка. На моей части участка был ветхий сарай. Я обратился в архитектуру района за получением разрешения на строительство жилого двухэтажного дома. Мне был подготовлен проект дома и выдано разрешение на строительство. В этом разрешении однако указано реконструкция дома. Архитектор сказал так как мой дом частично примыкает к дому соседа, поэтому считается реконструкцией. Собрав все соответствующие документы, я построил этот дом. После получил разрешение о вводе в эксплуатацию. Все коммуникации а также вход и въезд у меня отдельный от соседа. После с соседом мы решили сделать раздел участка и домов. Подготовили все документы для этого. В архитектуре города нам присвоили отдельные адреса. Сделали новые кадастровые паспорта на участки и дома. Словом все документы есть и мы с соседом подали их для получения новых свидетельств о праве собственности и на участок и на дом. Завтра я должен был получать эти свидетельства. Но вчера девушка позвонила и сказала что я не получу их потому что у меня в разрешении на строительство написано реконструкция а я построил новый дом. Она мне предлагает сходить в кадастровую палату и приостановить регистрацию. Прошу ответить уважаемый юрист как мне поступать дальше? Разве после реконструкции дома нельзя ли отделиться соседям? Разве я виноват что архитектор считает мое строительство реконструкцией, а регистратор считает строительством? Прошу разъяснит мои дальнейшие действия. Занимался я этим целый год. сейчас живу с семьей в данном доме, без прописки. Спасибо.