Нарушение трудового права стажёра

Я работаю в компании около месяца. При трудоустройстве со мной заключили не трудовой договор, а учебный (трудовой вообще не заключали). Ниже изложены пункты договора (кроме тех, где указаны стороны и их контакты): "УЧЕНИЧЕСКИЙ (УЧЕБНЫЙ) ДОГОВОР 1. Предмет договора 1.1, Настоящий договор заключен с целью получения Учеником дополнительно профессионального образования в форме повышения квалификации (далее - обучение), для получения профессии "Стажер-программист 1 С" и последующего выполнения трудовых обязанностей по этой профессии. 1.2. Обучение начинается с момента заключения данного договора, будет производиться на условиях неполного рабочего дня, продолжительностью 4-6 часов в день. 1.3. Продолжительность обучения составляет три месяца. 1.4. Форма обучения заочно-очная, в виде индивидуальных занятий с теоретическими и практическими заданиями. 2. Права и обязанности сторон договора 2.1. Работодатель обязан: - обеспечить Ученику возможность обучения в соответствии с условиями настоящего договора; - выплачивать Ученику стипендию в период обучения; - компенсировать Ученику все расходы, понесенные им, при покупке необходимой учебной литературы, транспортные расходы; - составить график работы Ученика, удобный для Работодателя и Ученика; 2.2. Работодатель вправе осушествлять контроль за процессом учебы Ученика 2.3. Ученик обязан: - соблюдать учебную дисциплину; - своевременно являться на все занятия В соответствии с расписанием занятий; - после окончания обучения проработать не менее 12 месяцев у Работодателя; - полностью возместить Работодателю стоимость обучения, включая денежные средства, полученные в качестве стипендии за все время обучения, B случаях, если Ученик по окончании ученичества без уважительных причин не выполнит своих обязательств по настоящему договору, в том числе не приступит к работе по окончании обучения; 3. Условия оплаты труда и учебы 3.1. На период обучения Ученику ежемесячно выплачивается стипендия в размере 10 000 рублей 4. Ответственность сторон 4.1. В случае невыполнения обязательств, предусмотренных настоящим договором, стороны несут ответственность в соответствии с действующим законодательством РФ. 4.2. В случае если Ученик не пройдет обучение, либо по окончании обучения, без уважительных причин, не будет выполнять свои обязательства по настоящему договору, в том числе не приступит к работе по новой специальности, то он, по требованию Работодателя, обязан двухмесячный срок возвратить последнему стоимость расходов, связанных с оплатой его обучения. При нарушении срока возврата вышеназванных сумм к Ученику может быть применена штрафная неустойка размере 0,1 % за каждый день просрочки до полного погашения задолжности. 4.3. При отказе Ученика добровольно возместить Работодателю понесенные им расходы на обучение, взыскание данного материального ущерба будет произведено в судебном порядке 5. Основания расторжения договора 5.1. Настоящий логовор расторгается по основаниям, предусмотренным для расторжения трудового договора 5.2 Договор может быть расторгнуть досрочно по соглашению сторон. 5.3. Ученик может быть освобождён от обучения, а настоящий договор расторгнут по инициативе работодателя в случаях: - систематического неисполнения Учеником, возложенных на него обязанностей; - прогула (в т.ч. отсутствии на учёбе трёх и боллее часов в течение дня) без уважительных причин; - совершения виновных действий Учеником, если они дают основание для утраты доверия к нему со стороны работодателя; Договор может быть расторгнут со стороны Ученика в случае: - Его болезни, препятствующей выполнению обязанностей по договору; - нарушения Работодателем трудового законодательства или условий договора; - по другим, предусмотренным законодательством о труде основаниям. 5.5. Во всех случаях расторжения договора стороны осуществляют все взаимные денежные расчеты как связанные с исполнением настоящего договора, так и по другим дополнительным соглашениям и договорам, действующим на дату расторжения договора 6. Прочие условия 6.1. Настоящий договор составлен в двух экземплярах, по одному для каждой стороны. Оба экземпляра имеют одинаковую юридическую силу 6.2. Настоящий договор вступает в силу с момента его подписания и действует до окончания обучения, продолжительность которого предусмотрена п. 1.3 договора. 6.3. Возникшие по договору споры разрешаются путем переговоров. При не достижении согласия споры разрешаются в установленном законодательством порядке. 6.4. Действие договора продлевается на время болезни Ученика, а также в других случаях, предусмотренных ТК PФ. 6.5. Вопросы, не урегулированные настоящим договором, разрешаются в порядке, установленном действующим законодательством 7. Реквизиты сторон" Но заплатили 5 тысяч рублей в итоге и сказали, что это стипендия. Помимо этого, я подписывала какую-то расписку (наверно то, что локальный акт изучен), где были прописаны штрафы за опоздания, мои ставки... сказали что это главнее, чем то, что в договоре, но точной копии у меня, к сожалению, нет. Я подписала её, и она осталась у бухгалтера. Самое же тревожное — это практика работы с контрагентами. Выяснилось, что за работу, на которую я трачу 1 час, клиенту выставляется 2 часа. Мне на это объяснили, что идет некий аукцион между франчами, и так они выигрывают по цене. По сути, контрагентов вводят в заблуждение о реальной трудоемкости. Прочитав на сайте: https://kontur.ru/articles/6724#header_25811_1 Я уже поняла, что со мной не заключили трудовой договор. В локальных документах, которые я подписывала у меня стоят штрафы за опоздание, которые незаконны (но вроде со стипендии штрафы не сняли). Мне должны оплачивать отдельно стипендию и отдельно ту работу, которую я делаю. Я хочу уволиться. Что нарушается в этом договоре? Куда могу обратиться и по каким статьям? Должна ли я им что-то выплачивать? Завтра планирую попросить ещё раз показать эту расписку (или акт) и сфотать его. Что мне им сказать и что спросить? Что делать, если она откажет в предоставлении этого документа. Законно ли это? Буду очень благодарна за Ваш совет