Можно ли подать иск в Мировой суд и попросить выдать судебный приказ по иску о взыскании долга по договору займа, сумма 100 т. р.

Можно, но не нужно. Выдача судебного приказа предусматривает отсутствие ответчика в суде, пониженный размер госпощлины. Но если ответчик получив приказ, заявит, что он с ним не согласен, приказ будет отменен, а Вы лишитесь права решить вопрос в порядке искового судопроизводства. Потому что второй раз те же самые требования к тому же лицу заявлять нельзя.